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MMHP | 完成超13萬(wàn)例!華大智造推進(jìn)“百萬(wàn)微生態(tài)”合作新階段

時(shí)間:2023-12-22 18:04:22   來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)

  近日,由21個(gè)機(jī)構(gòu)和10多個(gè)參與國(guó)家共同努力的全球最大國(guó)際微生態(tài)研究計(jì)劃——“百萬(wàn)微生態(tài)” (Million Microbiome of Humans Project,MMHP)披露最新進(jìn)展,基于華大智造測(cè)序平臺(tái)已完成樣本量測(cè)序超13萬(wàn)例,較過(guò)去半年翻倍增長(zhǎng)。

  

  MMHP于2019年在國(guó)際基因組學(xué)會(huì)議(ICG-14)上正式啟動(dòng),目標(biāo)是在三到五年內(nèi)對(duì)100萬(wàn)份人類樣本的微生物DNA進(jìn)行測(cè)序和分析,重點(diǎn)是糞便和唾液,旨在構(gòu)建世界上最大的人類微生物組數(shù)據(jù)庫(kù)。據(jù)了解,項(xiàng)目主要?jiǎng)?chuàng)始成員和聯(lián)盟所在的核心實(shí)驗(yàn)室,如卡羅林斯卡研究所的AmbioGen、丹麥哥本哈根大學(xué)和法國(guó)國(guó)家農(nóng)業(yè)科學(xué)院宏基因組研究所MetaGenoPolis將承擔(dān)樣本核心測(cè)序工作,而其他支持實(shí)驗(yàn)室,如德國(guó)ALACRiS Theranostics和法國(guó)Nahibu生物技術(shù)公司則發(fā)揮輔助支持作用。

  MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院微生物轉(zhuǎn)化研究中心主任Lars Engstrand教授表示:“MMHP旨在利用高通量測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,加速和推進(jìn)宏基因組學(xué)研究,這其中一項(xiàng)重點(diǎn)工作就是如何創(chuàng)新和應(yīng)用可大規(guī)模部署的最佳工作流程。這樣所有的參與方都可以使用簡(jiǎn)化的流程,產(chǎn)生有價(jià)值的數(shù)據(jù)以促進(jìn)高質(zhì)量、全面的腸道微生物組圖譜開(kāi)發(fā)!

  在樣品收集的同時(shí),MMHP聯(lián)盟基于華大智造測(cè)序和自動(dòng)化產(chǎn)品,進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)工作流程的最終優(yōu)化工作。這套完整的工作流程將適配測(cè)序?qū)嶒?yàn)中涉及的所有關(guān)鍵點(diǎn),確保數(shù)據(jù)的質(zhì)量與可靠性。

  

  MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、倫敦大學(xué)學(xué)院教授Stanislav Dusko Ehrlich教授表示:“一旦認(rèn)識(shí)到人類微生物組組成對(duì)健康的重要性,微生物組分析在現(xiàn)代醫(yī)療實(shí)踐的高結(jié)合度是很容易理解的。因此,加強(qiáng)對(duì)這個(gè)復(fù)雜的微生物世界的理解變得勢(shì)在必行。通過(guò)傳播這項(xiàng)技術(shù)并加速這一新興領(lǐng)域的采用,我們的目標(biāo)就是釋放微生物組學(xué)在創(chuàng)新醫(yī)療解決方案的巨大潛力!

  與傳統(tǒng)技術(shù)相比,隨著宏基因組學(xué)的速度和精度越來(lái)越受到科學(xué)界的歡迎,MMHP聯(lián)盟致力于通過(guò)向參考實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)移技術(shù)來(lái)分享領(lǐng)域?qū)I(yè)知識(shí)。在華大智造先進(jìn)的測(cè)序技術(shù)、完善的實(shí)驗(yàn)工作流程及各項(xiàng)目成員的支持下,MMHP的目標(biāo)是在2024年繼續(xù)增強(qiáng)參考實(shí)驗(yàn)室矩陣的能力,使宏基因組學(xué)能夠惠及人人。

  MMHP前10,000個(gè)樣本的性能分析結(jié)果證實(shí)了華大智造DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)具有高度一致性的表現(xiàn)。與常規(guī)DNA陣列相比,DNBSEQ測(cè)序技術(shù)具備低重復(fù)序列、低標(biāo)簽跳躍、信號(hào)密度高、平衡高通量和高質(zhì)量數(shù)據(jù)的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。借助DNBSEQ測(cè)序技術(shù),參與機(jī)構(gòu)能夠擴(kuò)展宏基因組學(xué)的應(yīng)用和能力,有助于進(jìn)一步開(kāi)展相關(guān)研究和精準(zhǔn)醫(yī)療。

  除了可以接入標(biāo)準(zhǔn)化的微生物組分析協(xié)議和基于華大智造測(cè)序平臺(tái)的鳥(niǎo)槍法宏基因組測(cè)序外,參與MMHP的其他好處還包括可以提前獲取聯(lián)盟生成的數(shù)據(jù),并可成為相關(guān)研究論文的共同作者。該項(xiàng)目最終將實(shí)現(xiàn)100萬(wàn)份樣本的測(cè)序和分析。當(dāng)前,項(xiàng)目組歡迎醫(yī)學(xué)、科學(xué)及業(yè)界機(jī)構(gòu)的積極參與,共同為研究人類健康和疾病中的微生物組學(xué)作出貢獻(xiàn),改善全球健康。

(責(zé)任編輯:華康)

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